配额分配制度主要包括免费分配和拍卖分配，免费分配又根据不同的标准分为“祖父法”和“基准线法”，前者是依据企业历史排放水平进行分配，后者是先确定行业基准，再依据企业的实际产量进行分配。
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尽管所有理论和实证研究都指出碳配额拍卖分配可以确保系统的高效透明并产生更好的减排效果，但为了减少政策阻力，欧盟碳市场在初期还是选择主要以免费的方式进行配额分配，同时由于缺少排放数据，分配主要采用“祖父法”。这就意味着，污染者主要根据其历史排放量就能获得免费的排放权，历史排放量越高获得免费分配的配额越多。显然“祖父法”违反了“污染者付费”这一基本的公平原则。为此，欧盟从第三阶段开始逐步提高配额拍卖的比例，并计划最终实现100%有偿拍卖，同时免费分配的配额主要采用“基准线法”。“基准线法”使得碳排放强度高的设施依据其产量将少分配到配额，这就促使低效的设备要采取措施减少过多的排放，从而解决分配不公的问题。
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欧盟碳市场改革措施及经验总结 本`文@内/容/来/自:中-国^碳-排-放^*交*易^网-tan pai fang. com
面对碳价不断发生硬着陆，市场几度濒临崩溃和持续低迷，欧盟进行了一系列改革，对促进市场公平，稳定碳价，减少配额盈余，起到了积极的作用。同时，欧盟碳金融产品和服务的快速发展，也促进了碳价发现机制的形成。
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