为避免政策阻力，中国碳市场初期也要以免费分配作为主要配额分配制度，但应吸取欧盟碳市场初期采用“祖父法”导致虚报历史数据的教训，积极发动各行业专家研究以基准线法为主的初期分配方案，确保配额分配的相对公平，并最终实现以拍卖为主的配额分配制度。此外，还要结合我国实际，配额分配除了要满足碳强度下降指标，还要充分考虑经济增速变动、能源和产业结构调整等因素，并根据不同行业的发展规划，使配额分配向鼓励发展的行业倾斜。
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