环保部环境规划院环境经济部主任葛察忠认为：对环保部和省级环保部门影响较小，对基层环保部门影响较大，主要体现在两方面。
首先，《征求意见稿》提出环保税将由税务征收、环保协同，这意味着环保部门部分职能将发生转移。过去由环境监察执法队伍负责的排污收费职能，将转移到税务部门，环保部门可以将腾出来的人力和物力充实到一线的环境执法上去。因此，排污费改环境税将可以节省部分环保行政资源。
同时，环保部门也要配合税务部门进行协同，即在税务机关发现纳税人有申报数据明显不实、逃避纳税等行为的，可提请环保部门审核纳税人的污染物排放情况。这对环保部门提出了新的要求。
其次，基层环保部门的很大一块资金来源没有了，尤其是市级和县级环保部门。2003年的《条例》规定排污费必须纳入财政预算，列入环境保护专项资金进行管理，主要用于重点污染源防治、区域性污染防治、污染防治新技术、新工艺的开发、示范和应用以及国务院规定的其他污染防治项目的拨款补助或者贷款贴息。 内-容-来-自；中_国_碳_0排放￥交-易=网 t an pa i fa ng . c om
尽管如此，但是地方都按照此前的惯性，将环保能力建设和部分人力开支以项目的形式纳入排污收费资金使用盘子。后来，财政和环保部门通过完善中央环保专项资金项目申报指南的方式，又重新为环保自身建设可以使用排污费开了政策的口子，带动了地方一批相关政策的出台。所以，排污收费对基层环保部门而言非常重要，不仅可以用于自身能力建设，还可以用于确因工作需要而产生的超编人员的工资。在排污费改税之后，这部分收入就没有了，需要新的渠道去填充。
国家工信部备案/许可证编号京ICP备11044150号 
