在参与企业的选择上，德国将国内所有机器设备的二氧化碳排放量进行调查，按照《京都议定书》和相关法律的要求，对于排放量达到一定数额以上的设备，其生产企业要在与联邦环保局达成自愿协议的基础上，经审核才可取得一定的排放权，并进行排放交易。在2002~2003年期间，德国共调查3909家企业，其中1849家企业经审查参与了2005~2007年排放权交易。这些企业中，属于能源设备企业1234家，占67％；工业企业615家，占33％。
每个企业自己在申报排放权指标时都要做许多具体工作，如按照技术标准核实自己的机器设备排放二氧化碳情况等。联邦环保局也要对全部企业机器设备排放情况进行调查核定。对于特定工业企业按现行行业最高排放量发放，发放许可后，在一定时间内可以变更。
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排放权交易的申报程序是：申报过程中，如果生产企业属于洲管辖，则要先向洲环保局申报并审核，由洲再向联邦政府环保局申请；如果企业属于联邦政府，则直接向联邦环保局申请。只有联邦政府环保部门才是唯一受理并分配排放权的部门。
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具体步骤是：第一步，由工业企业按网上统一格式填报排放权申请书，并通过网络传到联邦环保局认定的排放权咨询机构；第二步，由咨询机构将审核建议通过电子邮件反馈给报送企业；第三步，工业企业按照反馈的初审意见将拟申请的排放数额交联邦环保局排放权交易管理部门；第四步，联邦环保局排放权交易部门审核申请并计算排放权额度；第五步，联邦环保局排放权管理部门将核定的排放权通知下达给工业企业。
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